У Красного черепа был какой-то там кубик, который он пересобрал в мелкую девчонку и воспитал её в духе гидры. Эта девчонка дофига чего может (а в первую очередь - изменять сознание людей), и когда встретила постаревшего кэпа, который просирал какую-то там битву, то снова омолодила его, заодно промыв ему сознание и сделав агентом гидры. Поэтому у него воспоминания о том, что его будто бы завербовали в 30-х, чего на самом деле не было.
Потом он как-то вправил свои мозги обратно.
Не, говно - все попытки натянуть ежа на глобус, выдумав какой-то свой фанатский таймлайн, в котором все нестыковки объяснены. Реально же дыр в этой серии столько, что лучше и не пытаться найти какую-то логику.
Потом он как-то вправил свои мозги обратно.