Ну вообще-то если установленная в начале фильма логика таймтревела в том, что изменения в прошлом не влияют на будущее, а создают новые таймлайны, то всё совершенно логично и просто. Будущее, из которого пришли Мстители с украденными камнями, не изменилось по возвращении, потому что прошлое этого таймлайна осталось тем же. Точно так же, не важно что произошло с таймлайном из которого пришла Гамора, по логике фильма это даже не прошлое, а другая вселенная, из которой она спопаданилась.
Еще раз, Гамора и мертвый Танос из прошлого существуют в "стандартном" таймлайне, а того таймлайна, из которого они пришли, уже может не существовать, потому что кэп вернул фиолетовый камень. События в родном таймлайне никак не должны влиять на тебя, если ты физически в другом таймлайне, это было объяснено.
Но ведь Гамора - это теперь часть "стандартного" таймлайна, как и мертвый Танос с его армией, с чего бы ей исчезать? Последствия его атаки на Мстителей ведь не исчезли, когда кэп вернул камни.
Великая же вроде говорила, что таймланы и их события привязаны именно к камням бесконечности (похожая концепция в Steins;Gate, где они привязаны к крупным историческим событиям, остальные изменения не могут его серьезно сломат), возвращение камня удаляет альтернативные таймланы.
Соглашусь, таймлайн с Тесерактом в любом случае проебан, но не из-за кэпа. К 2012 он уже будет старый и небоеспособный, потому что не сидел во льдах, да и вмешиваться - это значит мешать самому себе из оригинального таймлайна.
Как я уже сказал, это сделано было намеренно, ради красивой сцены со скамейкой. Как вернулся - в комиксах всегда можно придумать, там и Пим например есть, или Старк, с которым у него были десятки лет, чтобы подружиться и найти способ, взяв координаты из костюма, в котором он прилетел.
Ну в случае с таймлайном без Таноса, его как раз можно предотвратить, вернув камень силы в хранилище, чтобы его забрал Старлорд и все пошло своим чередом. Но в случае с Локи все гораздо сложнее, даже если вернуть камень в хранилище в 50-х, то это не предотвратит события, когда он спиздит его в 2012'м и сбежит. Но это похоже на завязку к грядущему сериалу про его приключения.
Что касается кэпа, то он вполне себе мог прожить свою спокойную жизнь в чужом таймлане инкогнито и ни во что не вмешиваясь.
Не называли они это дырой, они сказали, что он прожил жизнь в другом таймлайне и вернулся. Проблема только в том, каким способом. Неизвестно, что случилось в другом таймлайне и из какого года он вернулся обратно (скорее всего сразу после смерти Пегги в Винтер Солдере), ясно только что он это сделал не через свой квантовый костюм.
Что касается кэпа, то он вполне себе мог прожить свою спокойную жизнь в чужом таймлане инкогнито и ни во что не вмешиваясь.